公司前身是1957年成立的國營延邊敦化鹿場，于1981年建立敖東制藥廠，1993年經吉林省經濟體制改革委員會批準，成立延邊敖東藥業（集團）股份有限公司，1998年更名為吉林敖東藥業集團股份有限公司，1996年10月28日在深交所掛牌上市。2001年，吉林敖東建立母子公司體制，逐步發展成為以醫藥產業為基礎，以“醫藥+金融+大健康”多輪驅動模式快速發展的控股型集團上市公司。自敖東制藥廠建立以來，始終秉承“救濟世人”的傳統美德，恪守“世人健康，敖東職責”的經營理念，為社會提供安全、可靠、放心藥。公司優化產業結構調整，建設敦化市吉林敖東工業園、延吉市吉林敖東高新科技制藥園、洮南市吉林敖東植物化學藥生產基地，形成醫藥制造產業集群，支撐公司不斷創新發展，帶動制藥技術不斷升級，以產品質量的精益求精贏得消費者的持續信賴。目前公司共控股21家子公司，其中包括6家從事現代中藥、生物化學藥和植物化學藥的專業制藥子公司，1家醫藥研發子公司，5家醫藥銷售子公司，5家醫藥配套子公司，2家高端保健品公司，1家公路建設收費公司，1家敖東國際（香港）實業有限公司。